Vznik kostela se odhaduje kolem roku 1334, ale rozhodně není vyloučeno, že má starší původ. Nejprve byl kostel dřevěný, později kamenný. Mladoboleslavská mecenáška Kateřina Militká nechala kostel na své náklady přestavět v pozdněgotickém slohu v roce 1566. Kostel byl pak v roce 1702 přestavěn po požáru města v barokním slohu stavitelem Mikulášem Rossim. O kališnické minulosti Mladé Boleslavi svědčí kamenný kalich umístěný v levém okně na průčelí kostela. Vnitřek kostela zdobí renesanční fresky, nejcennějším předmětem je bezesporu gotická křtelnice z druhé poloviny 15. století.